Görgey rosszallotta a kormány új haditervét, de a súlyos pillanatban nem akart szakadást előidézni. Megígérte tehát, hogy seregével levonul Szegedre – és ezt az ígéretét soha nem vonta vissza. Össze kellett vonnia levonuló seregét, ezért azt írta, hogy leghamarabb július 3-án tud elindulni, valószínűleg csak a Duna bal partján. „Így a kormány parancsainak saját meggyőződésemet áldozom fel” – írta a Csány* féle küldöttséggel útnak indított június 30-i, 940. iktatószámú levelében Kossuthnak. Kossuth ezt a levelet gyorsan kézhez is kapta. Úton volt azonban egy másik, még a Csány* féle küldöttség megérkezése előtt írt, ugyancsak június 30-án kelt, 939. iktatószámú Görgey-levél is Kossuthhoz. Mivel ez a szokásos szolgálati úton érkezett, később került Kossuth kezébe, mint a Csányékkal* küldött levonulási ígéret. Ebben a 939 számú levélben Görgey még azt fejtegette, amit a korábbi haditerv értelmében tenni akart: „Komárom oltalma alatt összpontosítani minden erőt Bem, Vetter* és Kazinczyn kívül, és az osztrákokat eldöntőleg megtámadni.” Kossuth nem vizsgálta meg a levelek tartalmát, és indokolatlanul leváltotta Görgeyt a fővezérségből, Mészáros Lázár* altábornagyot nevezve ki helyébe. Ezt egy körrendeletben a hadsereg-, hadtest- és hadosztályparancsnokok tudomására hozta, Görgeynek, Klapkának, Wysockinak*, Kmetynek* és Vetternek* külön is írt. Kossuth rendelete július 2-án ért Komáromba – akkor, amikor Görgey egy védelmi csatában nemcsak hogy visszaverte a csaknem kétszeres túlerőben levő osztrák–orosz ellenség támadását, hanem a Pestre vezető utat is nyitva tartotta a levonulás céljaira. Ebben a csatában Görgey megsebesült: egy gránátrepesz 12–15 cm hosszúságban az agyvelőig felhasította a koponyáját. Az új fővezér nem tett komoly kísérletet arra, hogy átvegye a parancsnokságot, csak egy futártisztet küldött be a várba, ő maga hajójával visszafordult a félútról. Ludvigh* és Újházy* László komáromi kormánybiztos egyelőre eltitkolta a sereg elől a legújabb fejleményeket. Kossuth körrendeletét három példány egybevetése alapján közöljük: Wysocki* vezérőrnagynak: OL H 2. OHB 1849:8879.; Klapka* vezérőrnagynak: OL R 295. Klapka György iratai. 1. cs. 3. tét. 1849. július 2. fol.; Kászonyi* ezredesnek, a II. hadtest új parancsnokának: OL P 295. A Görgey-család levéltára. 37. cs. 10/d/1 tét. 2–5. fol.